《我的朋友很少》羽濑川小鹰转学到教会学校圣克罗尼亚学园已经过了一个月了，却因为被误认为不良少年而一直无法融入班级当中。6月某日，小鹰目击到平时总是一脸不高兴的同班同学三日月夜空一个人在教室里开心的自言自语。夜空辩解说自己是在和空想好友聊天，谈著谈著就谈到到底要怎样才能交到朋友。小鹰提到只要加入社团就好，夜空最初因为错过加入时期而反对，但后来想到只要自己成立社团就好，变成立了邻人社这个社团，还强迫小鹰参加。没想到邻人社不断有奇怪的美少女加入……